我们人类正常情况下，眼跳每隔6到20秒就会眨眼一次，眼皮才会跳动一次，正常时眼睑肌肉纤维的收缩很微弱而不会察觉；但当支配轮匝肌和提睑肌的神经受干扰而产生神经冲动时，就可能造成轮匝肌或提睑肌痉挛或颤动，而明显感受眼皮不自主地跳动了。
由于眼皮跳动属于肌肉放电的生理现象，以生理学来说是因控制眼轮匝肌的末梢神经上的“神经髓鞘电位”，过度放电而导致“短路”引起肌肉跃动，现在就来讨论有那些原因会影响神经放电了。
熬夜过劳
因眼皮跳而来求诊的患者中，十之八九都是不明原因的；而很多患者在眼皮跳前几天，都有熬夜过劳的情况，可能因此导致肌肉疲劳，致使眼轮匝肌及提睑肌不平衡，产生不正常跃动。
睡不足压力大
睡眠不足及压力过大会导致肌肉不正常收缩；而眼轮匝肌和提睑肌受到影响而产生不自主跃动。
咖啡等刺激物太多
咖啡喝太多有人会心悸，可见得咖啡因对神经传导的影响颇大；因此也有不少患者发作前，喝太多咖啡或茶等刺激性饮品的经验。
缺钙
由于钙是神经传导很重要的物质，因为缺钙而眼皮跳的患者，通常也会合并嘴角抽动以及手抖的症状。
颜面神经麻痹、中风
有些患者眼皮持续跳了几小时到几天以后，就出现嘴歪脸斜现象，游家铭表示，颜面神经麻痹症状在发病2天内，神经麻痹的程度达到顶点。而在明显症状出现前，患者除常有类似感冒或病毒感染症状外，常合并眼皮异常感，如眼皮跳或眼睛无法正常闭合；而中风患者除眼皮跳外，还合并嘴歪无法闭合及半侧无力等症状。
局部肌张力不全
局部肌张力不全的患者也很常见，患者常在紧张时眼皮不自主地用力眨动，过去前副总统连战经常用力眨眼，就可能是此症。
妥瑞氏症
妥瑞氏症的患者也常合并眼皮跳等局部肌肉跳动症状，不过通常都会并发怪声、注意力不集中等其它症状。
眼睛疾病
眼睛有近视、远视或散光等屈光不正问题，以及倒睫毛、结膜炎、角膜炎等也可能导致眼皮反射性痉挛跳动。
颅内肿瘤
根据统计，病态性的眼皮跳约有1％可能是因颅内肿瘤、蜘蛛网膜粘连等原因，而造成颜面神经刺激。
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